2008年秋季地区大会上位進出校
| 出場枠 | 優勝 | 準優勝 | ベスト4 | ベスト8 | |||||
| 北海道 | 1 | 鵡川 | 北海学園札幌 | 駒大岩見沢 | 函館大有斗 | 旭川実業 | 北照 | 北見柏陽 | 東海大四 |
| 東北 | 2 | 光星学院 | 一関学院 | 花巻東 | 利府 | 聖光学院 | 青森山田 | 東陵 | 酒田南 |
| 関東 | 6 | 慶應義塾 | 習志野 | 前橋商業 | 高崎商業 | 木更津総合 | 下妻第二 | 水戸桜ノ牧 | 川口青陵 |
| 東京 | 国士舘 | 早稲田実業 | 帝京 | 明大中野 | 足立新田 | 東京 | 駿台学園 | 駒大高 | |
| 北信越 | 2 | 日本文理 | 富山商業 | 福井工大福井 | 新潟商業 | 遊学館 | 佐久長聖 | 長野日大 | 敦賀気比 |
| 東海 | 2 | 中京大中京 | 掛川西 | 静清工業 | 享栄 | 三重 | 大垣日大 | 東邦 | 大垣商業 |
| 近畿 | 6 | 天理 | PL学園 | 金光大阪 | 福知山成美 | 箕島 | 報徳学園 | 大阪桐蔭 | 東洋大姫路 |
| 中国 | 5 | 倉敷工業 | 南陽工業 | 鳥取城北 | 開星 | 作陽 | 岩国 | 邇摩 | 新庄 |
| 四国 | 西条 | 今治西 | 高松商業 | 尽誠学園 | 丸亀 | 高知 | 明徳義塾 | 鳴門工業 | |
| 九州 | 4 | 清峰 | 神村学園 | 明豊 | 興南 | 福岡大大濠 | 九州国際大付 | 秀岳館 | 波佐見 |